A cidade dispõe de um hospital (Fundação Hospitalar Dr.Honor Teixeira da Costa, com 24 leitos hospitalares, 23 deles pelo Sistema Único de Saúde – SUS – e um não SUS) e algumas unidades básicas de saúde (UBS), que são a UBS Central – na Rua Dr. Pires Porto -, a UBS Olaria, a UBS Promorar e a UBS Ibaré.
O hospital (Fundação Médico-Hospitalar Dr. Honor Teixeira da Costa) tem uma estrutura básica para atendimento, mas recebeu algumas melhorias nos últimos anos, como pintura, reformas e aquisição de equipamentos.
Segundo dados de 2023 do Ministério da Saúde – Departamento de Informática do SUS (DATASUS), ocorreram no Hospital 345 internações. Também foram registrados 19 óbitos, com uma taxa de mortalidade de Há o trabalho comunitário por parte de agentes de saúde, que realizam assistência a gestantes, nutrição das crianças, saúde preventiva e proteção contra doenças diversas. Desde 2011, atuam ambulâncias do Sistema de Atendimento Móvel de urgência (SAMU) na cidade. Em 2016, a Prefeitura de Lavras do Sul adquiriu uma UTI Móvel.
A esperança de vida ao nascer dos lavrenses é, segundo o IBGE, com dados de 2010, de 77,05 anos (em 2000, era 71,13 anos). Serão atualizados em breve os dados deste indicador referentes ao Censo Demográfico 2022.
Recentemente influenciando no cotidiano das pessoas ao redor do mundo – desde 31 de dezembro de 2019 -, o Covid-19 teve seus primeiros casos registrados no município em maio de 2020. Foi um período difícil para Lavras do Sul, que não pode realizar grandes eventos por mais de um ano. Em 21 de janeiro de 2021, a enfermeira Dayse Nanci Teixeira D’Avila foi a primeira lavrense a ser vacinada contra a doença.
Meses mais tarde, o menino Arthur Monteiro foi a primeira criança a receber a vacina. Atualmente (2024), a doença está controlada, após uma grande mobilização de vacinação da Secretaria Municipal de Saúde, embora ocorram ainda pequenos surtos, com alguns casos isolados. Segundo dados de 03/01/2023, 85,2 da população total de Lavras do Sul estava com o esquema vacinal completo. Também, segundo a mesma fonte, foram distribuídas 21.549 doses da vacina.