Lavras do Sul tem uma área de 2.601 km² (260.100 hectares), distribuída em dois Distritos (Sede, 1.261 km² e Ibaré, 1.340 km²). Localiza-se na região da Campanha do Rio Grande do Sul, a 82 km de Bagé, 64 km de Caçapava do Sul, 180 km de Santa Maria e 320 km de Porto Alegre).

O clima é subtropical úmido, com verões quentes e invernos rigorosos e chuvas distribuídas anualmente (chuvas de 1.600 mm e temperatura média anual de 18°C).

A altitude média de Lavras do Sul (zona urbana) é de 277 m acima do mar. Porém, há regiões no limite com São Gabriel, que chegam a 470 m acima do nível do mar. Possui um baixo planalto de origem granítica, rochoso, com vegetação mais densa e variada na porção oriental (leste) e terrenos de campos, gramíneas e capões de mato na porção ocidental (oeste). Está todo o Município inserido no Bioma Pampa.

O território lavrense é banhado por duas bacias hidrográficas: a do Rio Camaquã (lado leste do município, correspondente a 53% do território); e a do Rio Santa Maria / Uruguai (47% do território, porção oeste). Apresenta o Marco Gaúcho das Águas, na localidade da Meia Lua, interior do município, que simboliza o encontro das águas das principais bacias hidrográficas do Rio Grande do Sul.

Aos poucos a mineração retorna aos destaques econômicos de Lavras do Sul. O subsolo lavrense, segundo diversos estudos nacionais e internacionais, uma grande quantidade de rochas, por conta de seu passado geológico e transformações da evolução continental, que proporcionou antiga atividade vulcânica e rochosa no território do município.